[Medical AI with Python:P57] 徹底理解!Transformerの計算フロー・主要テンソル・パラメータ 一覧

Transformerの計算フロー:主要数式一覧

処理段階数式意味・目的
語彙埋め込み\( \mathbf{X} = \text{Embed}(\text{tokens}) \)入力トークンをベクトルに変換
位置埋め込みの加算\( \mathbf{H}^{(0)} = \mathbf{X} + \mathbf{P} \)単語の順序情報を加える
Queryの計算\( \mathbf{Q} = \mathbf{H}^{(l)} \mathbf{W}_Q \)入力を「問い」に変換
Keyの計算\( \mathbf{K} = \mathbf{H}^{(l)} \mathbf{W}_K \)入力を「答えの鍵」に変換
Valueの計算\( \mathbf{V} = \mathbf{H}^{(l)} \mathbf{W}_V \)入力を「内容」に変換
Attentionスコア\( \mathbf{S} = \frac{ \mathbf{Q} \mathbf{K}^\top }{ \sqrt{d_k} } \)関連度を計算(内積+スケーリング)
Attention重み\( \mathbf{A} = \text{softmax}(\mathbf{S}) \)注目度を確率分布に変換
Self-Attention出力\( \mathbf{Z} = \mathbf{A} \mathbf{V} \)加重平均による文脈ベクトル生成
各ヘッドの出力\( \text{head}_i = \text{Attention}(\mathbf{QW}_Q^i, \mathbf{KW}_K^i, \mathbf{VW}_V^i) \)異なる視点での注意
Multi-Head結合\( \mathbf{M} = \text{concat}(\text{head}_1, \dots, \text{head}_h) \)全ヘッドの出力を統合
線形変換\( \mathbf{O} = \mathbf{M} \mathbf{W}_O \)次層用に整形
残差接続+正規化①\( \mathbf{H}’ = \text{LayerNorm}(\mathbf{H}^{(l)} + \mathbf{O}) \)Attentionの安定化
FFN第1層\( \mathbf{F}_1 = \text{ReLU}(\mathbf{H}’ \mathbf{W}_1 + \mathbf{b}_1) \)非線形変換(意味の抽象化)
FFN第2層\( \mathbf{F}_2 = \mathbf{F}_1 \mathbf{W}_2 + \mathbf{b}_2 \)元の次元に戻す
残差接続+正規化②\( \mathbf{H}^{(l+1)} = \text{LayerNorm}(\mathbf{H}’ + \mathbf{F}_2) \)FFN後の出力を安定化
最終出力\( \mathbf{H}^{(L)} \)Transformer全体の出力(最終層)
語彙スコア(Logits)\( \text{logits}_t = \mathbf{h}_t \cdot \mathbf{E}^\top \)各語彙に対応するスコア
出力確率\( \mathbf{p}_t = \text{softmax}(\text{logits}_t) \)次の語の出現確率

Transformerの計算フローを具体的な数値で追ってみよう(小型モデルで図解用)

以下では、Transformerの内部処理をすべて数値付きで辿れるよう、小さなモデル設定に基づいて具体的に説明します。

モデル設定(例)

項目
語彙数 \( V \)8語
文長 \( T \)5トークン(例:「糖 尿 病 の 治療」)
埋め込み次元 \( d \)4
ヘッド数 \( h \)2
各ヘッド次元 \( d_k = d/h \)2
FFN中間層次元 \( d_{ff} \)6

① Embeddingと位置符号化:入力文をベクトルで表すまで

Transformerでは、文字列(単語やサブワード)をそのまま扱うことはできません。まずは「トークンID」へ変換した後、それぞれを意味のある数値ベクトルへ変換する必要があります。

ステップ1:トークンIDへの変換

たとえば、以下のような5語からなる日本語の短い入力文があるとします:

入力文:糖 尿 病 の 治療
トークン列:[1, 2, 3, 4, 5]

ステップ2:語彙埋め込み行列からベクトルへ変換

Transformerは、各トークンIDを多次元ベクトルに変換するために、語彙埋め込み行列 \( \mathbf{E} \in \mathbb{R}^{8 \times 4} \) を持っています。

この行列は、語彙数(ここでは8語)に対して、それぞれの単語に対応する4次元の意味ベクトルを保持しています。

たとえば、以下は5つのトークンに対応するベクトルを取り出して並べた埋め込みベクトル列 \( \mathbf{X} \in \mathbb{R}^{5 \times 4} \) の例です:

\[
\mathbf{X} =
\begin{bmatrix}
0.1 & 0.3 & -0.1 & 0.2 \\
-0.2 & 0.0 & 0.5 & 0.1 \\
0.3 & 0.1 & -0.3 & 0.4 \\
0.0 & -0.1 & 0.2 & 0.2 \\
0.1 & 0.4 & 0.1 & -0.1 \\
\end{bmatrix}
\]

この段階で、入力された文は「5個のトークン × 各トークン4次元のベクトル」という形で数値化されました。

ステップ3:位置符号(Positional Encoding)の加算

Transformerはリカレント(時系列)構造を持たないため、トークンの「順序情報」を別途与える必要があります。

そのため、位置埋め込み行列 \( \mathbf{P} \in \mathbb{R}^{5 \times 4} \) を使い、各トークン位置(1〜5)に対応する位置ベクトルを以下のように加算します:

\[
\mathbf{H}^{(0)} = \mathbf{X} + \mathbf{P}
\]

たとえば、以下のような位置埋め込みがあったとします:

\[
\mathbf{P} =
\begin{bmatrix}
0.0 & 0.1 & 0.0 & 0.1 \\
0.1 & 0.0 & 0.1 & 0.0 \\
0.2 & 0.1 & 0.0 & 0.1 \\
0.3 & 0.0 & 0.1 & 0.0 \\
0.4 & 0.1 & 0.0 & 0.1 \\
\end{bmatrix}
\]

これを加算した結果:

\[
\mathbf{H}^{(0)} =
\begin{bmatrix}
0.1 & 0.4 & -0.1 & 0.3 \\
-0.1 & 0.0 & 0.6 & 0.1 \\
0.5 & 0.2 & -0.3 & 0.5 \\
0.3 & -0.1 & 0.3 & 0.2 \\
0.5 & 0.5 & 0.1 & 0.0 \\
\end{bmatrix}
\]

このようにして、各単語はその「意味(埋め込み)」と「文中の位置(位置符号)」の両方を反映したベクトルとして初期入力が完成します。

まとめ:ここまでの処理

  • 文字列 → トークンIDに変換
  • トークンID → 埋め込み行列を使ってベクトルへ変換(意味の数値化)
  • 位置埋め込みを加算して順序情報を与える

この結果得られた \( \mathbf{H}^{(0)} \in \mathbb{R}^{5 \times 4} \) は、Transformerモデルの最初の層(Self-Attention)に入力される、文の数値的な「初期表現」です。

② Self-Attention(各ヘッド)

各ヘッドごとに、以下のように Query, Key, Value を計算します。

\[
\mathbf{Q}_i = \mathbf{H}^{(l)} \mathbf{W}_Q^i \quad \mathbf{K}_i = \mathbf{H}^{(l)} \mathbf{W}_K^i \quad \mathbf{V}_i = \mathbf{H}^{(l)} \mathbf{W}_V^i
\]

各行列のサイズは以下の通りです:

  • \( \mathbf{W}_Q^i, \mathbf{W}_K^i, \mathbf{W}_V^i \in \mathbb{R}^{4 \times 2} \)
  • \( \mathbf{Q}, \mathbf{K}, \mathbf{V} \in \mathbb{R}^{5 \times 2} \)

スコア行列:

\[
\mathbf{S} = \frac{\mathbf{Q} \mathbf{K}^\top}{\sqrt{2}} \in \mathbb{R}^{5 \times 5}
\]

Softmaxにより Attention重み:

\[
\mathbf{A} = \text{softmax}(\mathbf{S}) \in \mathbb{R}^{5 \times 5}
\]

文脈ベクトル出力:

\[
\mathbf{Z}_i = \mathbf{A} \mathbf{V}_i \in \mathbb{R}^{5 \times 2}
\]

③ Multi-Head Attention

すべてのヘッド出力を結合:

\[
\text{concat}(\mathbf{Z}_1, \mathbf{Z}_2) \in \mathbb{R}^{5 \times 4}
\]

線形変換で統合:

\[
\mathbf{O} = \text{concat} \cdot \mathbf{W}_O \quad \left( \mathbf{W}_O \in \mathbb{R}^{4 \times 4} \right)
\]

④ 残差接続とLayer Normalization(1回目)

\[
\mathbf{H}’ = \text{LayerNorm}(\mathbf{H}^{(l)} + \mathbf{O}) \in \mathbb{R}^{5 \times 4}
\]

⑤ Feed Forward Network(FFN)

重み行列:

  • \( \mathbf{W}_1 \in \mathbb{R}^{4 \times 6} \)
  • \( \mathbf{W}_2 \in \mathbb{R}^{6 \times 4} \)

処理:

\[
\mathbf{F}_1 = \text{ReLU}(\mathbf{H}’ \cdot \mathbf{W}_1 + \mathbf{b}_1) \in \mathbb{R}^{5 \times 6}
\]

\[
\mathbf{F}_2 = \mathbf{F}_1 \cdot \mathbf{W}_2 + \mathbf{b}_2 \in \mathbb{R}^{5 \times 4}
\]

⑥ 残差接続とLayer Normalization(2回目)

\[
\mathbf{H}^{(l+1)} = \text{LayerNorm}(\mathbf{H}’ + \mathbf{F}_2) \in \mathbb{R}^{5 \times 4}
\]

⑦ 出力生成(語彙スコアと確率)

Transformer最終出力:

\[
\mathbf{H}^{(L)} \in \mathbb{R}^{5 \times 4}
\]

語彙埋め込みの転置:

\[
\mathbf{E}^\top \in \mathbb{R}^{4 \times 8}
\]

各トークン位置 \( t \) におけるスコアと確率:

\[
\text{logits}_t = \mathbf{h}_t \cdot \mathbf{E}^\top \in \mathbb{R}^{8}
\]

\[
\mathbf{p}_t = \text{softmax}(\text{logits}_t) \in \mathbb{R}^{8}
\]

まとめ:小さな数値でTransformerを視覚化

このように、文長や次元数を小さく設定することで、Transformerの計算フローを図やイラストで直感的に可視化しやすくなります。図解を行う際には、各テンソルのサイズ・役割・変換先を対応させることが重要です。

Transformerモデルにおける主要テンソル・パラメータ 一覧

名称記号形状役割・意味
語彙埋め込み行列\( \mathbf{E} \)\( V \times d \)語彙IDを意味ベクトルに変換。Decoderでは出力時にも再利用(共有)。
トークン埋め込み列\( \mathbf{X} \)\( T \times d \)入力文の各トークンを埋め込んだベクトル列。
位置埋め込み行列\( \mathbf{P} \)\( T \times d \)単語の並び順をベクトル空間に埋め込む。
初期入力ベクトル\( \mathbf{H}^{(0)} = \mathbf{X} + \mathbf{P} \)\( T \times d \)Self-Attention層への初期入力。
各層の出力(隠れ状態)\( \mathbf{H}^{(l)} \)\( T \times d \)第 \( l \) 層の出力ベクトル(全層同形状)。
クエリ重み行列\( \mathbf{W}_Q \)\( d \times d_k \)入力をクエリ空間に変換。
キー重み行列\( \mathbf{W}_K \)\( d \times d_k \)入力をキー空間に変換。
バリュー重み行列\( \mathbf{W}_V \)\( d \times d_k \)入力をバリュー空間に変換。
スコア行列\( \mathbf{S} = \frac{\mathbf{Q} \mathbf{K}^\top}{\sqrt{d_k}} \)\( T \times T \)各トークン間の相関スコア。
Attention重み\( \mathbf{A} \)\( T \times T \)スコアのsoftmax正規化後。
Attention出力(単一ヘッド)\( \mathbf{Z} \)\( T \times d_k \)重み付きValueベクトルの合成結果。
マルチヘッド出力(結合)\( \text{concat}(head_1,\dots,head_h) \)\( T \times d \)全ヘッドを結合した出力。
多頭統合用線形変換\( \mathbf{W}_O \)\( d \times d \)マルチヘッドの出力を再統合。
FFNの1層目\( \mathbf{W}_1 \)\( d \times d_{ff} \)非線形変換用の中間層。
FFNの2層目\( \mathbf{W}_2 \)\( d_{ff} \times d \)元の次元に戻す線形層。
最終出力ベクトル\( \mathbf{H}^{(L)} \)\( T \times d \)語彙スコア計算に用いる最終表現。
語彙スコア(logits)\( \text{logits}_t = \mathbf{h}_t \cdot \mathbf{E}^\top \)\( V \)各語彙に対するスコア。
語彙の出現確率\( \mathbf{p}_t = \text{softmax}(\text{logits}_t) \)\( V \)次の語が出現する確率分布。


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この記事を書いた人

医師・医学博士・AI研究者・連続起業家
元厚生労働省幹部・ハーバード大学理学修士・ケンブリッジ大学MBA・コロンビア大学行政修士(経済)
岡山大学医学部卒業後、内科・地域医療に従事。厚生労働省で複数室長(医療情報・救急災害・国際展開等)を歴任し、内閣官房・内閣府・文部科学省でも医療政策に携わる。
退官後は、日本大手IT企業や英国VCで新規事業開発・投資を担当し、複数の医療スタートアップを創業。現在は医療AI・デジタル医療機器の開発に取り組むとともに、東京都港区で内科クリニックを開業。
複数大学で教授として教育・研究活動に従事し、医療関係者向け医療AIラボ「Medical AI Nexus」、医療メディア「The Health Choice | 健康の選択」を主宰。
ケンブリッジ大学Associate・社会医学系指導医・専門医・The Royal Society of Medicine Fellow

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